MTBE催化劑在長期使用中會因各種原因造成失活或中毒，大體可歸為以下幾種類型：

1、 陽離子交換中毒失活

醚化原料中存在的金屬離子或堿性氮化物（氨和胺），會通過離子交換，使樹脂催化劑上的磺酸基團被中和。其結果表現為催化劑的交換容量降低,活性中心減小.國內對此中毒的研究表明:陽離子交換中毒表現為活塞推移式,即沿催化劑床層深入,最先接觸這些雜質的床層先中毒,中毒飽和后依次推移,床層呈現明顯飽和段、過渡段和空白段。

煉廠碳四原料中常因上游水不好帶來的鈉離子及鈣離子，可溶性銹蝕物的鐵離子和鉻離子，催化裂化分子篩催化劑的微量鋁離子和硅離子，以及煉廠碳四原料中通常含有的氨、甲胺等堿性氮化物，都屬于陽離子交換的毒物。

2、 可水解氮化物導致中毒失活

采用分子篩催化劑的催化裂化碳四和碳五原料中通常含有腈類物質（如乙腈、丙腈），它們在醚化反應條件下與水反應直接水解而生成氨，導致中和催化劑的磺酸基團。蒸汽裂解碳四原料中會攜帶其上游丁二烯抽提的溶劑（DMF和NMP），它們與水反應的產物，也會與催化劑的磺酸基團作用，導致催化劑失活。應該注意：這些可水解氮化物造成的失活與上述陽離子交換失活形成的活塞推移式中毒有所不同，是屬于整個催化劑床層的擴散性中毒。

3、 磺酸基團的脫落

樹脂催化劑在較高溫度下會發生聚合鏈的斷裂和磺酸基團脫落，從而導致活性永久損失。據研究表明，樹脂脫磺與溫度密切有關。通常在大于80℃，樹脂開始有脫磺，至120℃脫磺則非常明顯。